El servicio de acuarios del IIM se encarga de suministrar agua de mar y aire a los distintos laboratorios y del mantenimineto de los equipos que lo componen.
Existen tres tipos de agua de mar según el grado de tratamiento que recibe:
1. Agua "cruda". Pasa sólo por el filtro de arena (50 micras)
2. Agua filtrada fría. Filtrada a 20 micras + UV y enfriada a 15ºC
3. Agua filtrada caliente. Filtrada a 20 micras + UV y calentada a 23ºC
Además este servicio se encarga del cultivo de fitoplancton para la alimentación de organismos filtradores. Para ello cuenta con una sala para el cultivo en bolsas de 60 litros, una cámara isoterma para los balones de 5 litros y un armario isotermo para los matraces.
Todas ellas acondicionadas a 20ºC y con iluminación continua.
Las especies de microalgas más utilizadas en el IIM son Isocrhysis galbana y Phaeodactylum tricomutum; en menor medida también se cultivan Chaetoceros gracillis, etc.
